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至顶网服务器频道高性能计算赖能和:HPC中心如何最大限度的提高资源利用率?

赖能和:HPC中心如何最大限度的提高资源利用率?

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在近日召开的英特尔2010年高性能计算研讨会上,来自中国石油东方地球物理公司研究院处理中心的总工程师赖能和先生,和我们分享了其如何最大限度利用HPC中心资源的经验,而这个经验想必对于很多HPC中心都是适用的。

作者:赵效民 来源:ZDNet【原创】 2010年7月5日

关键字: HPC 英特尔

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优化措施二:采用更高效的存储系统

当解决了内存瓶颈后,HPC计算节点的数据瓶颈也将向外移,此时负责数据外部交换的存储设备就承载了巨大的访问压力,而如果能进一步提高这一子系统的性能与效率,对于提高HPC的计算效率也无疑是有明显帮助的。

在存储系统的体系中,负责数据访问索引的文件系统有着重要的作用,而传统的NFS(网络文件系统)已经不适用于大规模的数据存取访问,为此BGP改用了IBM的GPFS(General Parallel File System,通用并行文件系统),使CPU的运行效率提升了2倍

GPFS的盘阵与DAS盘阵的性能对比,可见大并行计算也需要大并行存储的支撑

针对BGP的数据特点,采用了网络存储性能更高的NAS系统来代替传统的DAS系统,从而获得了2倍的I/O并发速度,同时也节省了大量的HBA卡

另外,BGP还引入了虚拟带库(VTL)来提高备份的效率,也大大提高了HPC中心的运行效率(备份窗口大大缩短)

与VTL相配合的,是一套完整的新开发的备份系统,可以自动的定制化的完成各站点的统一备份工作,也大大提高了HPC中心的运行效率,同时也提高了数据安全性,降低了人员维护强度

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