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刀片集群系统在高性能计算中的应用

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曙光公司根据多年在高性能计算机领域的积累,结合市场用户的实际需要,积极倡导高性能计算机的产品和技术规范,推出了第三代刀片曙光TC2600。

来源:ZDNet 2008年8月14日

关键字: 集群系统 高性能计算 处理器 刀片服务器 服务器 曙光 TC2600 浪潮

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4.曙光刀片集群系统

4.1.刀片的发展和趋势

刀片服务器经过持续的发展和改进,在技术和应用上已经成熟,刀片服务器获得不断高升的认可度,受到市场的欢迎。根据IDC的预测,到2009年刀片服务器在整个服务器市场份 额将会超过25%,出货量达到280万台,销售收入超过90亿美金。

第二代刀片服务器仅注重了计算密度,由于散热的问题,I/O问题没有很好的解决,尤其是不能支持各种标准规格的IO部件,限制了其应用。

刀片的发展需要一种标准的统一,对于用户而言,没有了统一的标准,将会造成使用上的迷惑与资源的浪费。基于此,曙光改变理念,提出了综合性能强大的刀片服务器,曙光TC2600作为代表来解决一直未决的疑虑。对于刀片的密度、散热、管理、I/O问题等都针对性的有了大的完善。

4.2.具备集群系统的所有优点

应用于高性能计算的刀片集群系统,具备通用的Cluster架构的所有优点,主要体现在:

  高性价比;
开放性,兼容性
  易扩展,扩展成本低
易管理使用
整体拥有成本低
使用灵活,尤其适合用户计算中心

4.3.刀片集群相对于机架式服务器集群的优点

4.3.1. 计算密度更高

提高计算密度是刀片服务器发展的主要动力之一。对于超级计算中心的大规模并行计算机来说,提高计算密度尤其重要。

峰值性能为10万亿次的曙光4000A,基于2U 4路机架式服务器,系统共包含45个计算机柜。而提供同样的计算能力,使用曙光刀片式集群,只需要3个机柜;计算系统提高10倍,构造100万亿次的超级计算机,也只需要25个机柜,占用200平米的机房空间。

4.3.2. 机房要求降低

大规模高性能计算机将对机房空间提出较高的要求,并且要为系统的扩容升级留下空间。刀片式集群系统实现了较高的计算密度,并且有效降低了系统功耗,对系统空调等散热系统的要求也相对降低。

4.3.3. 功耗散热降低

刀片服务器的功耗部件较少。刀片柜中的电源将由多个刀片共享,所以会使用高效率电源,减小了系统功耗,同时产生的热量减少,减少了冷却系统的耗电量。

节能的设计体现在曙光刀片服务器的各个层面:

1)根据实时功耗确定工作电源个数,使电源工作在最佳效率曲线上。
2)修改计算刀片操作系统内核,实现节能
3)多计算刀片任务调整调度

4.3.4. 布线简单

在机架式服务器构成的集群系统中,系统布线是一个很大的问题。系统的线缆可能包括高性能计算网络(Infiniband,Myrinet,以太网等)、数据网络、管理网络、监控网络、电源网络、KVM网络等,这些线缆需要连接到每一个计算单元。尤其是在高密度、计算单元数目又比较多的情况下,系统布线是令设计人员头疼的问题。

刀片式集群系统可以大大减少系统布线的数量。多个刀片服务器可以共用冗余电源,内置的交换机将高速网络(Infiniband等)、数据网络、管理网络、KVM网络集成在一起,只需要对刀片柜进行布线,刀片柜内部的计算刀片通过背板连接,无需布线。

根据计算,使用刀片式集群,可以节省85%以上的系统布线。

4.3.5. 可靠性提高

曙光刀片服务器采用无源背板进行系统互连,与传统的线缆连接方式相比,把可靠性提高到了一个数量级以上。刀片系统采取模块化、冗余、热插拔设计,进一步提高了系统的可靠性。

可靠性的提高对高性能计算应用有着重要的价值。目前,采取进程动态迁移和Checkpoint来保证并行作业的可靠性还不成熟,所以对高性能计算机系统的整体可靠性要求比较高。在并行作业运行的一个周期内,要求所有参与运算的部件都不能出现故障,曙光刀片集群系统的高可靠性是其用户高性能计算的一大保证。

4.3.6. 管理方便

曙光刀片服务器管理监控高度集成:通过统一的监控界面,监控所有刀片资源,包括机箱电源、风扇、计算刀片、背板、交换机。管理系统整合目前两大监控技术,即IPMI以及KVM (Over IP),真正实现监视控制一体化。同时,为实现方便快捷的刀片服务器管理,通过优化的管理软硬件设计,改善可管理性,增强部署和可服务性,这些将降低总的所有权成本。

5.曙光刀片集群系统上的并行应用

5.1. 测试或移植的并行应用

5.1.1. 测试的软件列表(部分)

                      CAE领域中常用软件

名称

公司

简介

ANSYS

ANSYS

通用隐式有限元软件

NASTRAN

MSC

线性结构分析软件

MARC

MSC

非线性结构分析软件

ADINA

ADINA

非线性结构分析软件

ABAQUS

DASSAULT

通用隐式/显式有限元软件

LS-DYNA

LSTC

最出色的显式分析软件,用于冲击,碰撞,爆破,冲压成型加工等分析

DYTRAN

MSC

碰撞和冲击分析软件

PAM-CRASH

ESI

PAM系列的碰撞和冲击分析软件

MADYMO

TASS

汽车碰撞和乘员安全系统分析

RADIOSS

ALTAIR

汽车碰撞、冲击、噪声分析

ADAMS

MSC

机构动力分析软件

FEKO

EMSS

高频电磁分析软件

SYSNOISE

LMS

噪声分析软件

MOLDFLOW

MOLDFLOW

注塑成型、模具设计软件

PROCAST

ESI

铸造模拟软件

 

                                          CFD领域常用软件

软件名称

简介

Fluent

目前国际上比较流行的商用CFD软件包

CFX

一种实用流体工程分析工具

Star-CD

主要用于汽车工业,汽车发动机内的流动和传热。

Numeca

专业的旋转机械流体力学软件

Pheniox

模拟传热、流动、反应、燃烧过程的通用CFD软件

Fire

专注于汽车发动机燃烧和流动模拟,能够模拟复杂的化学反应过程。

Fastran

专注于航天航空工业,在模拟超高音速流动方面精度很高。

FDS

美国NIST出品的开源软件,采用大涡模拟方法模拟复杂的火灾过程。对计算要求很高,支持并行计算。

 
                                                           
                                                             多媒体、动画制作以及集群渲染领域

软件名称

简介

Maya

MAYA是一个很庞大的软件系统,而且它其中的许多操作已经成了行业规范,比如MAX的许多操作就借鉴了MAYA

3Ds MAX

 

在电视及娱乐业中,比如片头动画和视频游戏的制作 ,影视特效方面 ,建筑效果图和建筑动画制作中,3DS MAX的使用率更是占据了绝对的优势。

Lightwave

 

一款出色的三维动画软件

Softimage|XSI

 

Softimage/XSI 是一款巨型软件

Mental Ray

Mental Ray是在好莱坞被运用的重量级的渲染器之一

Render Man

Renderman pixar公司研发的一款专业渲染软件

Muster

目前应用比较广泛的一种渲染管理软件,是在跨平台上制作市面上最好的3D2D套装软件

Deadline

目前国内选用较多的一种集群渲染管理软件,支持多种渲染器

Enfusion for Render Farm

Axceleon公司的Enfusion渲染管理软件

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