浪潮天梭助力南方医科大生物信息科研

    ZDNetChina服务器站 高性能计算案例  近日，在南方医科大学生物信息技术系统项目招标中，基于四核处理平台的浪潮天梭TS10000高性能科学计算系统成功中标。据了解，采用四核处理单元构建的TS10000高性能科学计算系统在广东省还是首次，此次成功应用将把广东省的生物信息计算水平提高到一个新的水平。

    生物信息研究是当今世界科技发展的热点之一，在食品、制药、疾病防治等众多领域广泛应用。南方医科大学医学信息检测技术重点实验室隶属于南方医科大学基础医学院肿瘤研究所，长期致力于生物信息技术的分析和科研工作，曾经成功发现SARS病毒致命的主要物质成分，为治疗SARS药物的问世提供了可能。但是，现代生物信息研究对大规模科学计算有很深的依赖，平台性能对于科研进度及质量影响很大，南方医科大学医学信息检测技术重点实验室负责人表示，此次采用代表我国计算机业最高技术水平的浪潮天梭系统，将极大提高实验室的大规模数据处理能力。”

    此次浪潮中标关键正是在于掌握了用户应用需求脉搏。随着实验室的不断的发展，亟需一套高性能服务器平台，综合运用计算机科学、生物学的各种工具来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义。通过高性能服务器集群的并行算法，对获取的生物信息进行分配、分析、存储、解释，同时，还要满足基因比对排列运算、基因语言与调控、功能基因组学等自行开发的应用需要。浪潮服务器的负责人介绍，这种应用兼有计算密集型和通讯密集型的特点，浪潮提供的基于Intel四核处理节点平台的天梭TS10000集群系统，采用5+1的计算/管理配备方案，处理核心总数达到了40个，通过千兆以太网络进行各节点间的并行通讯和高速交换运算，充分满足客户对高性能计算系统的需要。在具体实施中，这套天梭TS10000高性能集群系统性能卓越、稳定的运行各类软件，并行效率与加速比分别高达80%和1.7，实际表现大大超出了用户预期。

    作为国产服务器第一品牌，浪潮一直密切关注国内的生物信息研究事业，以领先的技术无缝贴合客户应用。早在2003年，浪潮就为华中科技大学构建了大型生物信息数据中心，这是亚太地区第一套基于Infiniband技术的科学计算平台；06年底，中国四核第一单——19个节点的浪潮天梭成为中科大生命科学院的蛋白质结构解析平台。此次南方医科大学基于四核平台天梭系统的建成，不仅显露出浪潮在高性能计算领域雄厚的技术研发实力，也进一步巩固了浪潮在生物信息科研领域的优势地位。