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3.大规模刀片计算机群解决方案
3.1.设计原则
曙光TC2600刀片服务器也可以作为机群中的基本构建单元组成刀片计算机群。在搭建刀片计算机群中,我们需要考虑刀片服务器的特点,和机群方案进行结合,充分发挥刀片服务器密集度高的特点。
实际原则,从用户实际需求出发,遵照实际情况确定方案的选择与实施。
经济原则,刀片机群系统采用广泛应用且具有良好性能价格比的产品,既考虑节省投资,又保证产品的先进性和可用性。
完整原则,曙光机群的解决方案是一套针对特定领域、完整的高性能解决方案,无论从软硬件选择,具体根据用户的应用需求;特别的,我们在方案中还能根据我们的成功案例实施的情况,对于用户的管理和运行模式提出自己的建议。
扩展原则,系统支持动态扩展,在系统性能需要提升时,可以很方便地进行扩展。
易管理原则,机群服务器的管理方案非常简便,即保证了用户使用的方便性,也可以保证系统管理的有序性,高效性,避免管理上的混乱。
3.2.方案配置
曙光TC4000高性能计算机 | ||||
品目 |
设备名称 |
组成单元 |
单位 |
数量 |
节点机 | ||||
计算刀片柜1 |
曙光TC2600刀片柜 |
1×曙光TC2600刀片柜,可插10个刀片模块, |
台 |
4 |
刀片模块 |
10×计算刀片模块: | |||
网络模块 |
1×直通网络模块(Pass-though) | |||
1×交换网络模块(Switch Module) | ||||
管理模块 |
1×管理模块 | |||
IO节点 |
曙光天阔A620r-F |
2*Opteron 2218处理器2.6GHz, |
台 |
1 |
接入节点 |
曙光天阔A620r-F |
2*Opteron 2218处理器2.6GHz, |
台 |
1 |
控制台&视频切换子系统(SKVM) | ||||
控制台 |
内置控制台 |
19"标准,1U,含液晶显示器、8个标准VGA接口、笔记本键盘、笔记本鼠标、标准机柜上架套件 |
套 |
1 |
网络子系统 | ||||
高速计算网络 |
InfiniBand高速网络 |
1×Infiniband交换机9040,48个4X端口 |
套 |
1 |
41×Infiniband HCA卡10Gb/s,单端口Memfree | ||||
41×InfiniBand铜缆 | ||||
数据交换网 |
千兆交换机 |
48口千兆交换机 |
台 |
1 |
管理网 |
百兆交换机 |
24口百兆交换机 |
台 |
1 |
存储子系统 | ||||
存储系统 |
曙光存储 |
DS-8340FF,光纤盘阵,3U机架式,16槽位,双冗余电源,4个光纤主机通道 |
套 |
1 |
11×300GB SATA硬盘 |
块 |
曙光TC4000高性能计算机
4.Materials Studio计算机群解决方案
4.1.Materials Studio软件刀片解决方案
Materials Studio软件是Accelrys公司专为材料科学领域开发的的材料计算软件。Materials Studio软件采用Client/Server结构,客户端基于Windows系统,计算服务器可以进行灵活的配置,使得任何研究人员可以在熟悉的界面下轻易获得强大的计算模拟能力。客户可以从PC客户端向专用的Windows 系统、UNIX或Linux单个服务器提交计算,也可以向拥有大量计算资源的高性能计算机提交任务。工作可以在不连接模式下计算,这样他们与客户PC上的资源无关。Materials Studio软件在科学计算可视化方面具有独到领先的特色,极大的降低计算软件使用和数据分析的难度,受到科研人员的广泛欢迎和使用。遗憾的是,Materials Studio软件价格昂贵,所需计算有限,因此在设计方案中,我们必须要考虑到这点。
小型研究组原来采用的Materials Studio的解决方案主要是用户个人电脑加上一台昂贵的4路UNIX小型机,性价比非常低。曙光在自主研发的曙光TC2600刀片服务器的产品上,参考独立刀片解决方案可以为用户提供替代UNIX小型机的方案。
4.2.方案配置
计算刀片 |
TC2600刀片柜 |
1×刀片柜, |
License 服务器 |
1个计算刀片模块 2×AMD Opteron 2216双核处理器,2GB内存, 1×80GB SATA硬盘,Windows 2003,主要用于安装License,向其他接入台式机提供License验证服务,同时可以在该刀片模块上也可以建模,提交任务 | |
Gateway 服务器 |
1个计算刀片模块 2×AMD Opteron 2216双核处理器,2GB内存, 1×80GB SATA硬盘,Linux,主要用于安装Gateway服务器,也是计算的一部分 | |
刀片模块 |
8×计算刀片模块 2×AMD Opteron 2220 双核CPU,8GB内存, 1×80GB SATA硬盘,作为计算节点使用,由于Materials Studio License非常昂贵,因此需要追求单处理器核心处理能力高 | |
交换模块 |
1×千兆交换模块;每个交换模块可对外提供4个千兆RJ45接口; | |
管理模块 |
1×管理模块;可实现共享USB功能、KVM切换、刀片状态、故障定位、开关机等全方位管理控制监视功能; | |
刀片中文管理软件 |
基于Web浏览器的管理方式,可提供所有组件的最新状态及图形标示的详细信息;实时状态监控、故障预警,动态优化调整资源配给和工作策略;保存并统计分析关键历史数据;直观显现重要信息的变化趋势;多种错误故障报警方式,日志、审计和报表可供查询;允许加密的远程控制,可从任何位置控制操作及监控整体运行状况 | |
控制设备 |
控制设备 |
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