用于GPU的基因组测序软件帮助研究人员更快了解新型冠状病毒。
当危机袭来时,每个人都需全力以赴地应对危机。为应对此次新型冠状病毒疫情,NVIDIA为研究人员们提供了相关工具,使他们能够更快地了解COVID-19,并有助于研究应对措施。
自今日起,NVIDIA将向全球所有新型冠状病毒研究人员免费提供90天的Parabricks使用权。Parabricks基于著名的Genome Analysis Toolkit,可通过GPU将序列数据分析速度提高50倍。
我们认识到此次疫情正在不断变化,因此我们将密切关注疫情并根据需要提供更多的支持。
如果您可以使用NVIDIA GPU,请填写此表(地址:https://www.nvidia.com/en-us/docs/nvidia-parabricks-researchers/)申请Parabricks使用权。
使用Oxford Nanopore long-read数据的研究人员可在GitHub上找到GPU加速工具存储库。此外,以下应用已内置NVIDIA GPU加速功能:Medaka、Racon、Raven、 Reticulatus和Unicycler。
目前,研究人员正在对新型冠状病毒和COVID-19感染者的基因组进行测序,以了解疾病的传播方式并确定易感染人群。但分析基因组序列需要耗费大量的时间和计算力。
长期以来,加速科学研究始终都是NVIDIA的核心使命之一。 Parabricks团队于去年12月加入NVIDIA,为此项工作提供了最新的工具。它可以在一台服务器上快速分析一个人的全部基因组变异,将分析时间从几天缩短至一个小时以内。
鉴于此次疫情史无前例的传播速度,将获得结果的时间从数天缩短至数小时能够对了解病毒进化和疫苗开发产生巨大的推动作用。
NVIDIA正在邀请我们的合作伙伴与我们一同开展这项迫在眉睫的工作,为研究人员提供帮助。我们正在与云服务供应商和超级计算中心讨论在他们的平台上提供计算资源和Parabricks访问。
随着有更多资源可供使用,我们将更新本文中的相关链接,以提供NVIDIA GPU和本软件的云端访问。
好文章,需要你的鼓励
无人机食品配送服务商Flytrex与全球知名披萨连锁品牌Little Caesars宣布合作,推出全新Sky2无人机,最大载重达4公斤,可一次配送两个大披萨及饮料,满足全家用餐需求。Sky2支持最远6.4公里的配送范围,平均从起飞到送达仅需4.5分钟。首个试点门店已在德克萨斯州怀利市上线,并实现与Little Caesars订单系统的直接集成。
FORTIS是专门测量AI代理"越权行为"的基准测试,研究发现十款顶尖模型普遍选择远超任务需要的高权限技能,端到端成功率最高仅14.3%。
法国社会住房项目ViliaSprint?已正式完工,成为欧洲最大的3D打印多户住宅建筑,共12套公寓,建筑面积800平方米。项目由PERI 3D Construction使用COBOD BOD2打印机完成,整体工期较传统建造缩短3个月,实际打印仅用34天(原计划50天),现场操作人员从6人减至3人,建筑废料率从10%降至5%。建筑采用可打印混凝土,集成光伏板及热泵系统,能源自给率约达60%。
荷兰Nebius团队提出SlimSpec,通过低秩分解压缩草稿模型LM-Head的内部表示而非裁剪词汇,在保留完整词汇表的同时将LM-Head计算时间压缩至原来的五分之一,端到端推理速度超越现有方法最高达9%。