用于GPU的基因组测序软件帮助研究人员更快了解新型冠状病毒。
当危机袭来时,每个人都需全力以赴地应对危机。为应对此次新型冠状病毒疫情,NVIDIA为研究人员们提供了相关工具,使他们能够更快地了解COVID-19,并有助于研究应对措施。
自今日起,NVIDIA将向全球所有新型冠状病毒研究人员免费提供90天的Parabricks使用权。Parabricks基于著名的Genome Analysis Toolkit,可通过GPU将序列数据分析速度提高50倍。
我们认识到此次疫情正在不断变化,因此我们将密切关注疫情并根据需要提供更多的支持。
如果您可以使用NVIDIA GPU,请填写此表(地址:https://www.nvidia.com/en-us/docs/nvidia-parabricks-researchers/)申请Parabricks使用权。
使用Oxford Nanopore long-read数据的研究人员可在GitHub上找到GPU加速工具存储库。此外,以下应用已内置NVIDIA GPU加速功能:Medaka、Racon、Raven、 Reticulatus和Unicycler。
目前,研究人员正在对新型冠状病毒和COVID-19感染者的基因组进行测序,以了解疾病的传播方式并确定易感染人群。但分析基因组序列需要耗费大量的时间和计算力。
长期以来,加速科学研究始终都是NVIDIA的核心使命之一。 Parabricks团队于去年12月加入NVIDIA,为此项工作提供了最新的工具。它可以在一台服务器上快速分析一个人的全部基因组变异,将分析时间从几天缩短至一个小时以内。
鉴于此次疫情史无前例的传播速度,将获得结果的时间从数天缩短至数小时能够对了解病毒进化和疫苗开发产生巨大的推动作用。
NVIDIA正在邀请我们的合作伙伴与我们一同开展这项迫在眉睫的工作,为研究人员提供帮助。我们正在与云服务供应商和超级计算中心讨论在他们的平台上提供计算资源和Parabricks访问。
随着有更多资源可供使用,我们将更新本文中的相关链接,以提供NVIDIA GPU和本软件的云端访问。
好文章,需要你的鼓励
英特尔携手戴尔以及零克云,通过打造“工作站-AI PC-云端”的协同生态,大幅缩短AI部署流程,助力企业快速实现从想法验证到规模化落地。
意大利ISTI研究院推出Patch-ioner零样本图像描述框架,突破传统局限实现任意区域精确描述。系统将图像拆分为小块,通过智能组合生成从单块到整图的统一描述,无需区域标注数据。创新引入轨迹描述任务,用户可用鼠标画线获得对应区域描述。在四大评测任务中全面超越现有方法,为人机交互开辟新模式。
阿联酋阿布扎比人工智能大学发布全新PAN世界模型,超越传统大语言模型局限。该模型具备通用性、交互性和长期一致性,能深度理解几何和物理规律,通过"物理推理"学习真实世界材料行为。PAN采用生成潜在预测架构,可模拟数千个因果一致步骤,支持分支操作模拟多种可能未来。预计12月初公开发布,有望为机器人、自动驾驶等领域提供低成本合成数据生成。
MIT研究团队发现,AI系统无需严格配对的多模态数据也能显著提升性能。他们开发的UML框架通过参数共享让AI从图像、文本、音频等不同类型数据中学习,即使这些数据间没有直接对应关系。实验显示这种方法在图像分类、音频识别等任务上都超越了单模态系统,并能自发发展出跨模态理解能力,为未来AI应用开辟了新路径。